Olá amigo,
Provavelmente é defeito na placa mesmo, dependendo da versão da placa ela possui 4 chips 8 pinos que são multiplexadores das entradas que as vezes apresentam problemas de mau contato por serem soquetados, pode tentar aperta-los (com a placa desligada!) ou ainda troca-los de posição para ver se os canais com problema também variam.
Ou encaminhar a placa para a manutenção.
Um abraço