Olá amigo,
Acrescentando algumas opiniões a discussão posso afirmar, que vai depender muito também da aplicação. Se vai ter operador, qual a nível de utilização, facilidade de operação, necessidade de autonomia, capacidade de expansão e atualização e principalmente a facilidade de manutenção e suporte técnico.
Cada tipo de sistema tem suas vantagens, enquanto as placas de captura são mais flexíveis os DVRs são mais robustos.
Segue abaixo o link de um post antigo com mais informações:
http://www.guiadocftv.com.br/modules/newbb/viewtopic.php?topic_id=350&forum=2&post_id=1136#forumpost1136
Um abraço!